Depuis que j'avais mis à jour ma Debian, la souris ne fonctionnait plus correctement dans mon VMWare Windows que j'utilise pour accéder aux applications spécifiques du boulot. En effet, elle n'affectait plus la VM guest, donc je n'arrivais plus à contrôler le système.

J'ai trouvé la solution sur un blog anglophone: il suffit de lancer, à la place de vmplayer :

VMWARE_USE_SHIPPED_GTK=yes vmplayer

et voilà :)